/**
 *  \file DopePairScore.cpp
 *  \brief Dope score
 *
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 *
 */

#include <IMP/score_functor/Dope.h>

IMPSCORE_FUNCTOR_BEGIN_NAMESPACE

namespace {

  namespace data {

#define DOPE_TYPE(NameKey) const DopeType \
    Dope##NameKey(DopeType::add_key(#NameKey));
#define DOPE_TYPE_ALIAS(Name, Key) const DopeType Dope##Name\
  (DopeType::add_alias(DopeType(#Key), #Name));

    DOPE_TYPE(ALA_N)
    DOPE_TYPE(ALA_CA)
    DOPE_TYPE(ALA_C)
    DOPE_TYPE(ALA_O)
    DOPE_TYPE(ALA_CB)
    DOPE_TYPE(ARG_N)
    DOPE_TYPE(ARG_CA)
    DOPE_TYPE(ARG_C)
    DOPE_TYPE(ARG_O)
    DOPE_TYPE(ARG_CB)
    DOPE_TYPE(ARG_CG)
    DOPE_TYPE(ARG_CD)
    DOPE_TYPE(ARG_NE)
    DOPE_TYPE(ARG_CZ)
    DOPE_TYPE(ARG_NH)
    DOPE_TYPE_ALIAS(ARG_NH1, ARG_NH)
    DOPE_TYPE_ALIAS(ARG_NH2, ARG_NH)
    DOPE_TYPE(ASN_N)
    DOPE_TYPE(ASN_CA)
    DOPE_TYPE(ASN_C)
    DOPE_TYPE(ASN_O)
    DOPE_TYPE(ASN_CB)
    DOPE_TYPE(ASN_CG)
    DOPE_TYPE(ASN_OD1)
    DOPE_TYPE(ASN_ND2)
    DOPE_TYPE(ASP_N)
    DOPE_TYPE(ASP_CA)
    DOPE_TYPE(ASP_C)
    DOPE_TYPE(ASP_O)
    DOPE_TYPE(ASP_CB)
    DOPE_TYPE(ASP_CG)
    DOPE_TYPE(ASP_OD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(ASP_OD1, ASP_OD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(ASP_OD2, ASP_OD)
    DOPE_TYPE(CYS_N)
    DOPE_TYPE_ALIAS(CSS_N,CYS_N)
    DOPE_TYPE(CYS_CA)
    DOPE_TYPE_ALIAS(CSS_CA,CYS_CA)
    DOPE_TYPE(CYS_C)
    DOPE_TYPE_ALIAS(CSS_C,CYS_C)
    DOPE_TYPE(CYS_O)
    DOPE_TYPE_ALIAS(CSS_O,CYS_O)
    DOPE_TYPE(CYS_CB)
    DOPE_TYPE_ALIAS(CSS_CB,CYS_CB)
    DOPE_TYPE(CYS_SG)
    DOPE_TYPE_ALIAS(CSS_SG,CYS_SG)
    DOPE_TYPE(GLN_N)
    DOPE_TYPE(GLN_CA)
    DOPE_TYPE(GLN_C)
    DOPE_TYPE(GLN_O)
    DOPE_TYPE(GLN_CB)
    DOPE_TYPE(GLN_CG)
    DOPE_TYPE(GLN_CD)
    DOPE_TYPE(GLN_OE1)
    DOPE_TYPE(GLN_NE2)
    DOPE_TYPE(GLU_N)
    DOPE_TYPE(GLU_CA)
    DOPE_TYPE(GLU_C)
    DOPE_TYPE(GLU_O)
    DOPE_TYPE(GLU_CB)
    DOPE_TYPE(GLU_CG)
    DOPE_TYPE(GLU_CD)
    DOPE_TYPE(GLU_OE)
    DOPE_TYPE_ALIAS(GLU_OE1, GLU_OE)
    DOPE_TYPE_ALIAS(GLU_OE2, GLU_OE)
    DOPE_TYPE(GLY_N)
    DOPE_TYPE(GLY_CA)
    DOPE_TYPE(GLY_C)
    DOPE_TYPE(GLY_O)
    DOPE_TYPE(HIS_N)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_N, HIS_N)
    DOPE_TYPE(HIS_CA)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_CA, HIS_CA)
    DOPE_TYPE(HIS_C)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_C, HIS_C)
    DOPE_TYPE(HIS_O)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_O, HIS_O)
    DOPE_TYPE(HIS_CB)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_CB, HIS_CB)
    DOPE_TYPE(HIS_CG)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_CG, HIS_CG)
    DOPE_TYPE(HIS_ND1)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_ND1, HIS_ND1)
    DOPE_TYPE(HIS_CD2)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_CD2, HIS_CD2)
    DOPE_TYPE(HIS_CE1)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_CE1, HIS_CE1)
    DOPE_TYPE(HIS_NE2)
    DOPE_TYPE_ALIAS(HSD_NE2, HIS_NE2)
    DOPE_TYPE(ILE_N)
    DOPE_TYPE(ILE_CA)
    DOPE_TYPE(ILE_C)
    DOPE_TYPE(ILE_O)
    DOPE_TYPE(ILE_CB)
    DOPE_TYPE(ILE_CG1)
    DOPE_TYPE(ILE_CG2)
    DOPE_TYPE(ILE_CD1)
    DOPE_TYPE(LEU_N)
    DOPE_TYPE(LEU_CA)
    DOPE_TYPE(LEU_C)
    DOPE_TYPE(LEU_O)
    DOPE_TYPE(LEU_CB)
    DOPE_TYPE(LEU_CG)
    DOPE_TYPE(LEU_CD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(LEU_CD1, LEU_CD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(LEU_CD2, LEU_CD)
    DOPE_TYPE(LYS_N)
    DOPE_TYPE(LYS_CA)
    DOPE_TYPE(LYS_C)
    DOPE_TYPE(LYS_O)
    DOPE_TYPE(LYS_CB)
    DOPE_TYPE(LYS_CG)
    DOPE_TYPE(LYS_CD)
    DOPE_TYPE(LYS_CE)
    DOPE_TYPE(LYS_NZ)
    DOPE_TYPE(MET_N)
    DOPE_TYPE(MET_CA)
    DOPE_TYPE(MET_C)
    DOPE_TYPE(MET_O)
    DOPE_TYPE(MET_CB)
    DOPE_TYPE(MET_CG)
    DOPE_TYPE(MET_SD)
    DOPE_TYPE(MET_CE)
    DOPE_TYPE(PHE_N)
    DOPE_TYPE(PHE_CA)
    DOPE_TYPE(PHE_C)
    DOPE_TYPE(PHE_O)
    DOPE_TYPE(PHE_CB)
    DOPE_TYPE(PHE_CG)
    DOPE_TYPE(PHE_CD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(PHE_CD1, PHE_CD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(PHE_CD2, PHE_CD)
    DOPE_TYPE(PHE_CE)
    DOPE_TYPE_ALIAS(PHE_CE1, PHE_CE)
    DOPE_TYPE_ALIAS(PHE_CE2, PHE_CE)
    DOPE_TYPE(PHE_CZ)
    DOPE_TYPE(PRO_N)
    DOPE_TYPE(PRO_CA)
    DOPE_TYPE(PRO_C)
    DOPE_TYPE(PRO_O)
    DOPE_TYPE(PRO_CB)
    DOPE_TYPE(PRO_CG)
    DOPE_TYPE(PRO_CD)
    DOPE_TYPE(SER_N)
    DOPE_TYPE(SER_CA)
    DOPE_TYPE(SER_C)
    DOPE_TYPE(SER_O)
    DOPE_TYPE(SER_CB)
    DOPE_TYPE(SER_OG)
    DOPE_TYPE(THR_N)
    DOPE_TYPE(THR_CA)
    DOPE_TYPE(THR_C)
    DOPE_TYPE(THR_O)
    DOPE_TYPE(THR_CB)
    DOPE_TYPE(THR_OG1)
    DOPE_TYPE(THR_CG2)
    DOPE_TYPE(TRP_N)
    DOPE_TYPE(TRP_CA)
    DOPE_TYPE(TRP_C)
    DOPE_TYPE(TRP_O)
    DOPE_TYPE(TRP_CB)
    DOPE_TYPE(TRP_CG)
    DOPE_TYPE(TRP_CD1)
    DOPE_TYPE(TRP_CD2)
    DOPE_TYPE(TRP_NE1)
    DOPE_TYPE(TRP_CE2)
    DOPE_TYPE(TRP_CE3)
    DOPE_TYPE(TRP_CZ2)
    DOPE_TYPE(TRP_CZ3)
    DOPE_TYPE(TRP_CH2)
    DOPE_TYPE(TYR_N)
    DOPE_TYPE(TYR_CA)
    DOPE_TYPE(TYR_C)
    DOPE_TYPE(TYR_O)
    DOPE_TYPE(TYR_CB)
    DOPE_TYPE(TYR_CG)
    DOPE_TYPE(TYR_CD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(TYR_CD1, TYR_CD)
    DOPE_TYPE_ALIAS(TYR_CD2, TYR_CD)
    DOPE_TYPE(TYR_CE)
    DOPE_TYPE_ALIAS(TYR_CE1, TYR_CE)
    DOPE_TYPE_ALIAS(TYR_CE2, TYR_CE)
    DOPE_TYPE(TYR_CZ)
    DOPE_TYPE(TYR_OH)
    DOPE_TYPE(VAL_N)
    DOPE_TYPE(VAL_CA)
    DOPE_TYPE(VAL_C)
    DOPE_TYPE(VAL_O)
    DOPE_TYPE(VAL_CB)
    DOPE_TYPE(VAL_CG)
    DOPE_TYPE_ALIAS(VAL_CG1, VAL_CG)
    DOPE_TYPE_ALIAS(VAL_CG2, VAL_CG)
}

  IntKey get_dope_type_key() {
    static const IntKey ik("dope atom type");
    return ik;
  }
}



IMPSCORE_FUNCTOR_END_NAMESPACE