#!/usr/bin/env python
import cPickle
di={'ALA': {'HB': ('HB1', 'HB2', 'HB3'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2', 'HB3'),
         'QB': ('HB1', 'HB2', 'HB3')},
 'ARG': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD1', 'HD2'),
         'HD%': ('HD1', 'HD2'),
         'HG': ('HG1', 'HG2'),
         'HG%': ('HG1', 'HG2'),
         'HH1': ('HH11', 'HH12'),
         'HH1%': ('HH11', 'HH12'),
         'HH2': ('HH21', 'HH22'),
         'HH2%': ('HH21', 'HH22'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD1', 'HD2'),
         'QG': ('HG1', 'HG2'),
         'QH1': ('HH11', 'HH12'),
         'QH2': ('HH21', 'HH22')},
 'ASN': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD21', 'HD22'),
         'HD%': ('HD21', 'HD22'),
         'HD2': ('HD21', 'HD22'),
         'HD2%': ('HD21', 'HD22'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD21', 'HD22'),
         'QD2': ('HD21', 'HD22')},
 'ASP': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'CYS': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'GLN': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HE': ('HE21', 'HE22'),
         'HE%': ('HE21', 'HE22'),
         'HE2': ('HE21', 'HE22'),
         'HE2%': ('HE21', 'HE22'),
         'HG': ('HG1', 'HG2'),
         'HG%': ('HG1', 'HG2'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QE': ('HE21', 'HE22'),
         'QE2': ('HE21', 'HE22'),
         'QG': ('HG1', 'HG2')},
 'GLU': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HG': ('HG1', 'HG2'),
         'HG%': ('HG1', 'HG2'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QG': ('HG1', 'HG2')},
 'GLY': {'HA': ('HA1', 'HA2'), 'HA%': ('HA1', 'HA2'), 'QA': ('HA1', 'HA2')},
 'HIS': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'HSD': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'HSE': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'HSP': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'ILE': {'HD': ('HD1', 'HD2', 'HD3'),
         'HD%': ('HD1', 'HD2', 'HD3'),
         'HD1': ('HD1', 'HD2', 'HD3'),
         'HD1%': ('HD1', 'HD2', 'HD3'),
         'HG': ('HG11', 'HG12', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG%': ('HG11', 'HG12', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG1': ('HG11', 'HG12'),
         'HG1%': ('HG11', 'HG12'),
         'HG2': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG2%': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'QD': ('HD1', 'HD2', 'HD3'),
         'QD1': ('HD1', 'HD2', 'HD3'),
         'QG1': ('HG11', 'HG12'),
         'QG2': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'QQG': ('HG11', 'HG12', 'HG21', 'HG22', 'HG23')},
 'LEU': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'),
         'HD%': ('HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'),
         'HD1': ('HD11', 'HD12', 'HD13'),
         'HD1%': ('HD11', 'HD12', 'HD13'),
         'HD2': ('HD21', 'HD22', 'HD23'),
         'HD2%': ('HD21', 'HD22', 'HD23'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'),
         'QD1': ('HD11', 'HD12', 'HD13'),
         'QD2': ('HD21', 'HD22', 'HD23'),
         'QQD': ('HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23')},
 'LYS': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD1', 'HD2'),
         'HD%': ('HD1', 'HD2'),
         'HE': ('HE1', 'HE2'),
         'HE%': ('HE1', 'HE2'),
         'HG': ('HG1', 'HG2'),
         'HG%': ('HG1', 'HG2'),
         'HZ': ('HZ1', 'HZ2', 'HZ3'),
         'HZ%': ('HZ1', 'HZ2', 'HZ3'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD1', 'HD2'),
         'QE': ('HE1', 'HE2'),
         'QG': ('HG1', 'HG2'),
         'QZ': ('HZ1', 'HZ2', 'HZ3')},
 'MET': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HE': ('HE1', 'HE2', 'HE3'),
         'HE%': ('HE1', 'HE2', 'HE3'),
         'HG': ('HG1', 'HG2'),
         'HG%': ('HG1', 'HG2'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QE': ('HE1', 'HE2', 'HE3'),
         'QG': ('HG1', 'HG2')},
 'PHE': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD1', 'HD2'),
         'HD%': ('HD1', 'HD2'),
         'HE': ('HE1', 'HE2'),
         'HE%': ('HE1', 'HE2'),
         'HR': ('HD1', 'HD2', 'HE1', 'HE2', 'HZ'),
         'HR%': ('HD1', 'HD2', 'HE1', 'HE2', 'HZ'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD1', 'HD2'),
         'QE': ('HE1', 'HE2'),
         'QR': ('HD1', 'HD2', 'HE1', 'HE2', 'HZ')},
 'PRO': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD1', 'HD2'),
         'HD%': ('HD1', 'HD2'),
         'HG': ('HG1', 'HG2'),
         'HG%': ('HG1', 'HG2'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD1', 'HD2'),
         'QG': ('HG1', 'HG2')},
 'SER': {'HB': ('HB1', 'HB2'), 'HB%': ('HB1', 'HB2'), 'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'THR': {'HB': ('HB',),
         'HB%': ('HB',),
         'HG2': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG2%': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'QB': ('HB',),
         'QG2': ('HG21', 'HG22', 'HG23')},
 'TRP': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'QB': ('HB1', 'HB2')},
 'TYR': {'HB': ('HB1', 'HB2'),
         'HB%': ('HB1', 'HB2'),
         'HD': ('HD1', 'HD2'),
         'HD%': ('HD1', 'HD2'),
         'HE': ('HE1', 'HE2'),
         'HE%': ('HE1', 'HE2'),
         'HR': ('HD1', 'HD2', 'HE1', 'HE2'),
         'HR%': ('HD1', 'HD2', 'HE1', 'HE2'),
         'QB': ('HB1', 'HB2'),
         'QD': ('HD1', 'HD2'),
         'QE': ('HE1', 'HE2'),
         'QR': ('HD1', 'HD2', 'HE1', 'HE2')},
 'VAL': {'HG': ('HG11', 'HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG%': ('HG11', 'HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG1': ('HG11', 'HG12', 'HG13'),
         'HG1%': ('HG11', 'HG12', 'HG13'),
         'HG2': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'HG2%': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'QG': ('HG11', 'HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'QG1': ('HG11', 'HG12', 'HG13'),
         'QG2': ('HG21', 'HG22', 'HG23'),
         'QQG': ('HG11', 'HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23')}}
fl=open('CHARMM_pseudoatoms.dict','w')
cPickle.dump(di,fl)
fl.close()